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用多项式分布模型评估低质量DNA 模板微卫星分型的可靠性
晓光 齐, 保国 李, 松涛 郭, 轶 任, 学林 金, 刚 何, 维红 纪, 康 黄
Massey University Shaanxi Institute of Zoology
来源Chinese Science Bulletin (Chinese Version)
年份2011
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在使用痕量样品(如博物馆样品、古代样品、法医样品以及非损伤性样品)的分子遗传学研究中, 由于DNA 质量很低, 容易导致扩增错误的产生, 包括等位基因丢失和假等位基因. 本文建立了1 个区别对待纯合子和杂合子的多项式分布数学模型, 使用2 个参数衡量样品的质量, 在此基础上计算多管分型法的分型结果正确率. 为了检验此模型, 本研究从26 只秦岭地区川金丝猴(Rhinopithecus roxellana)个体采集非损伤性毛发样品, 使用5 个四核苷酸重复的微卫星位点进行扩增. 根据此模型, 实验获得3 次阳性PCR结果时, 分型结果正确率能够到达99%. 对于样品质量很低、需要过多重复实验的样品, 本文还推荐了1 种替代的分步分型方法, 能够进一步减少重复次数. 本模型有助于优化实验条件, 得到可靠的分型结果.
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学术脉络
学科主题
生物医学Genetic diversity and population structure
Forensic and Genetic Research · Molecular Biology Techniques and Applications
参考文献 32
Quality indexes to assess the reliability of genotypes in studies using noninvasive sampling and multiple‐tube approach
被引 145C. Miquel, Eva Bellemain, CAROLE POILLOT · Molecular Ecology Notes · 2006
Mitochondrial DNA Sequencing of Shed Hairs and Saliva on Robbery Caps: Sensitivity and Matching Probabilities
被引 200M Allen, Åke Engström, S Meyers · Journal of Forensic Sciences · 1998
此处列出前 3 条
引用本文 1
用多项式分布模型评估低质量DNA 模板微卫星分型的可靠性
被引 1晓光 齐, 保国 李, 松涛 郭 · Chinese Science Bulletin (Chinese Version) · 2011
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