Molecular Characterization of Variant Egyptian Avian Reovirus Isolates with Nucleotide Insertions and Deletions at the σC Coding Gene

Nota de investigación. Caracterización molecular de aislamientos de la variante egipcia de reovirus aviar con inserciones y deleciones de nucleótidos en el gene codificante σC. El reovirus aviar se considera un patógeno importante que afecta a la avicultura y recientemente ha recibido mayor atención debido a su diversidad genética, prevalencia y por las diversas enfermedades asociadas con su infección. En Egipto, las enfermedades asociadas con reovirus aviares se reportan con frecuencia a pesar de la implementación de programas de vacunación contra reovirus. Por lo tanto, la detección continua de nuevas variantes es esencial para mejorar las medidas de control. Durante este estudio, se recolectaron muestras de tres provincias egipcias para determinar las cepas circulantes de reovirus aviares. El análisis filogenético basado en las secuencias de aminoácidos de la proteína σC reveló la identificación de dos grupos de genotípicos (GC) de reovirus aviares (GC 4.4 y 5.2). La identidad de aminoácidos dentro de cada grupo fue superior al 94.9 %. Mientras tanto, la identidad de aminoácidos entre los dos grupos fue inferior al 37.8 %. Se encontró una baja identidad de aminoácidos (menos del 27.2 %) entre los aislados identificados y las cepas vacunales. Los aislados ReoHS3 y ReoHS6, relacionados con el grupo 4, se agruparon dentro de un clado distinto, compartiendo no más del 83.1 % de identidad de aminoácidos con las cepas más cercanas. Además, se encontró una inserción y deleción de nucleótidos única en la región de heptadas repetidas del gene codificante σC de estos dos aislados. A pesar de la deleción e inserción de nucleótidos y la hipervariabilidad en la región de heptadas repetidas, se mantuvo la misma longitud e hidrofobicidad en la posición “a” (y en cierta medida la posición “d”) entre los aislados identificados. Estos resultados pueden aclarar la importancia tanto de la longitud de la región de heptadas repetidas como de la hidrofobicidad en la posición “a” en el mantenimiento de la función de esta región.